2031 год. Прогресс в области кибернетики позволяет людям заменять утраченные конечности высокотехнологичными протезами. В центре событий — майор Мотоко Кусанаги, сотрудник 9-го отдела службы безопасности, расследующая деятельность загадочного хакера, известного под именем Кукловод.
Её команда сталкивается с серией сложных киберинцидентов, которые бросают вызов существующим методам расследования. Майор Кусанаги использует свои уникальные способности, чтобы раскрыть истинные мотивы таинственного злоумышленника, угрожающего безопасности города.